O ano é Depois da Colônia 195, e os meninos de Gundam decidiram pela paz eterna ao decidirem destruir suas armas robóticas, Gundams. A paz está quebrada, no entanto, quando Mariemaia Khushrenada, que afirma ser filha do falecido líder Oz, Treize, sequestra Relena e declara uma guerra de independência contra a Nação Unida da Esfera da Terra. Talvez seja a hora de retirar essas unidades da Gundam da aposentadoria.
Shin Kidou Senki Gundam Wing: Endless Waltz foi publicado em inglês como Gundam Wing: Endless Waltz por Tokyopop, primeiro no formato de quadrinhos, para um total de quatro edições, publicadas entre março e julho de 2002 e, posteriormente, no formato tankoubon padrão, em 1º de agosto de 2002.