Enquanto cavalgava com Jack Atlas e Crow Hogan, o dragão Stardust de Yuusei é capturado por Paradox, um misterioso Turbo Duelista do futuro, durante um Turbo Duel e transformado em um Monstro Sin. Com a ajuda do Dragão Carmesim, Yuusei persegue Paradox enquanto ele entra em um lapso de tempo, terminando no passado. Durante esse período, o Paradox duela contra Jaden Yuki, que ainda é capaz de usar os poderes do Yubel e do Rei Supremo. No entanto, a essa altura, o Paradox também havia capturado o Cyber End Dragon e o Rainbow Dragon e dominando Jaden. Ele é salvo graças a Yuusei e ao Dragão Carmesim. Jaden informa Yuusei das verdadeiras intenções de Paradox. Ao roubar vários monstros do tempo e torná-los sombrios, ele planeja matar Maximillion Pegasus, o criador de Duel Monsters, impedindo que o jogo seja criado e fazendo com que os eventos das três séries nunca aconteçam.Yuusei e Jaden concordam em persegui-lo , que os leva ao passado e causa um encontro com o rei dos jogos, Yuugi Mutou. No entanto, quando Yuusei e Jaden chegam, Paradox já havia atacado seu tempo, supostamente matando o avô de Pegasus e o avô de Yuugi, e também conseguiram roubar o dragão branco de olhos azuis e o dragão preto de olhos vermelhos. Depois de explicar tudo para Yuugi, ele concorda em lutar com Yuusei e Jaden contra Paradox no último duelo de três em um para libertar os monstros presos e salvar o mundo e o tempo antes que seja tarde demais. (Fonte: Wikipedia)