Quando um portão para outro mundo se abre repentinamente na Terra, a cidade de Mikado é invadida por estranhas criaturas conhecidas como "vizinhos", seres maliciosos impermeáveis ao armamento tradicional. Em resposta à sua chegada, uma organização chamada Agência de Defesa de Fronteiras foi criada para combater a ameaça ao vizinho através de armas especiais chamadas "Triggers". Embora vários anos tenham se passado após a abertura do portão, os vizinhos ainda são uma ameaça e os membros da fronteira permanecem em guarda para garantir a segurança do planeta. Apesar dessa situação delicada, os membros em treinamento, como Osamu Mikumo, não são permissão para usar seus gatilhos fora da sede. Mas quando o misterioso novo aluno de sua turma é arrastado para uma área proibida por agressores, eles são atacados por vizinhos, e Osamu não tem escolha a não ser fazer o que acredita ser certo. Para sua surpresa, no entanto, o estudante transferido Yuuma Kuga faz pouco trabalho com os alienígenas, revelando que ele é um vizinho humanóide disfarçado.
O World Trigger também foi adaptado para um jogo de ação PlayStation Vita exclusivo do Japão intitulado World Trigger: Missão Sem Fronteiras, e um jogo para iOS e Android intitulado World Trigger: Smash Borders.
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