Baseado em um livro de ilustrações intitulado Hakofugu no Negai (O Desejo do Peixe de Caixa) de Sakana-kun, a história é sobre o personagem principal, Hakofugu, que não tem certeza de si mesmo, que conhece Himetatsu, uma criança perdida, e juntos eles começam sua aventura para o "Mar de Minamata".