Os agressores geralmente têm como alvo alguém frágil e fraco - alguém exatamente como Yuugi Mutou. Sua linda amiga de infância, Anzu Mazaki, está sempre lá para defendê-lo, mas ele não pode depender dela para sempre. Katsuya Jonouchi, que quase sempre é acompanhado por seu parceiro de treino verbal Hiroto Honda, também não parece uma pessoa ruim, apesar de sempre trazer problemas para ele. Mas, acima de tudo, Yuugi deseja um verdadeiro amigo que o entenda e nunca o trairá. OYuugi valoriza seu Millennium Puzzle, um antigo artefato egípcio que foi trazido para a loja de jogos de seu avô. Acreditando que resolver o enigma lhe concederá seu desejo, ele o completa, desencadeando uma nova personalidade dentro dele - a alma do "King of Games.". Escura, distorcida, forte e confiável, a nova personalidade chamada Yami Yuugi é exatamente o oposto de Yuugi. Sob qualquer injustiça contra ele, Yami Yuugi toma conta do corpo de itab Yuugi e força o oponente a um "Jogo das Sombras". As apostas são altas, pois quem perde terá um gostinho da escuridão que reside dentro de seu próprio coração.
Yu☆Gi☆Oh! adapta vagamente os primeiros 59 capítulos do mangá de origem, adicionando eventos e personagens originais não presentes no mangá.
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