Faz dois anos e meio desde que Naruto Uzumaki deixou Konohagakure, a vila oculta das folhas, para treinamento intenso após eventos que alimentaram seu desejo de ser mais forte. Agora, a Akatsuki, a misteriosa organização dos ninjas desonestos de elite, está se aproximando de seu grande plano que pode ameaçar a segurança de todo o mundo shinobi. A embora Naruto seja um evento mais antigo e sinistro no horizonte, ele mudou pouco de personalidade - ainda indisciplinado e infantil - embora agora ele esteja muito mais confiante e possua uma determinação ainda maior para proteger seus amigos e sua casa. Seja o que for, Naruto continuará com a luta pelo que é importante para ele, mesmo às custas de seu próprio corpo, na continuação da saga sobre o garoto que deseja se tornar Hokage.