O mundo foi dividido em duas metades por uma parede gigante para evitar a epidemia de "névoa escura". Para proteger os refugiados, cidades artificiais chamadas "Arks" foram construídas. Shido Enishi é um detetive particular que trabalha na nona Arca. Um dia, ele é convidado a capturar um ladrão. O caso aparentemente simples o leva a uma grande conspiração.
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