Depois que um meteoro atinge a Terra, as forças traidoras (para todos os efeitos) assumiram o controle e as pessoas estão sofrendo. No caos, um garoto chamado Tetsuro Daiba, que havia perdido seus pais no golpe do meteoro, recebe uma visita de Mello, uma mulher misteriosa que aparece sob uma luz forte. Quando Daiba chega, ele se encontra em uma enfermaria de naves espaciais sob observação. Roubando um lutador que ele não sabia pilotar (até tentar), ele começa a voar como um profissional total.Ele foi capaz de se lembrar de como pilotar a partir de sua memória de DNA ... e descobrir mais, seu amigo médico o leva ao seu laboratório secreto subterrâneo, no qual ele atua como professor para descobrir maneiras de parar o regime de traidores. Quando as forças invadem para levá-lo de volta, uma garota chamada Rei Yuuki misteriosamente abate toda a sua nave com apenas um avião de caça! Aparentemente, ambos têm poderes misteriosos que os inimigos desejam, que podem ou não estar conectados ao fato de serem os únicos dois sobreviventes conhecidos do impacto do meteoro. Ao procurar um terceiro sobrevivente (que acabou sendo um gato), os dois são levado à força para a rainha Photon (governante do regime de traidores), que afirma que está fora de salvar a Terra daqueles que enviaram o meteoro. Os dois não sabem se acreditam nela ou em Mello até que o gato (telepático) os tire da câmara selada do Queens, e Mello começa a endireitar as coisas. É quando os dois (er, três) fazem uma escolha ... Permanecem em um planeta que não pode apoiar sua raça avançada ou atacam o desconhecido espaço? (Fonte: ANN)
Harlock é o herói romântico arquetípico, um pirata espacial com uma filosofia de vida individualista. Ele é tão nobre quanto taciturno, rebelde, lutando estoicamente contra regimes totalitários, sejam...