A história se passa em um futuro próximo, em um mundo nascido da imaginação humana. O que os humanos chamariam de fantasmas ou monstros aparecem e passam a ser chamados de "fantasmas". O personagem principal, Haruhiko Ichijou, é o primeiro ano na Academia de Oséias, juntamente com seu veterano Mai Kawakami, que luta contra fantasmas com a habilidade "Espírito dos Cinco Elementos", Reina Izumi, que tem a habilidade "Comedor Fantasma" e Koito Minase, que luta com fantasmas. solidão. Eles experimentam os altos e baixos da vida no ensino médio antes que um determinado incidente os leve à verdade deste mundo. (Fonte: ANN)
Musaigen no Phantom World recebeu uma menção honrosa na categoria romance do 4º Prêmio de Animação de Kyoto em 2013.