No ano 298 da era dos deuses, as garotas da escola primária Sumi Washio, Sonoko Nogi e Gin Minowa são encarregadas de uma importante missão. Eles devem se tornar heróis e lutar contra Vertex, um inimigo misterioso que está atacando Shinju-sama, a árvore dos deuses que protege Shikoku, a única área do mundo que ainda é habitável. O que eles não sabem é que essa luta lhes custará mais do que eles jamais poderiam imaginar.