Seis anos após a conclusão da Guerra de Um Ano (UC0086~0087). Uma menina que perdeu não só seus pais, mas sua própria memória por uma colônia que cai graças ao Zeon, é recrutada em um instituto de pesquisa de novo tipo (os Laboratórios Murasame). Depois de vaguear sem objetivo, ela se torna o sujeito de teste número 004 (também conhecido como "Quatro"). Aqui ela é treinada para se tornar um ser humano fortalecido com dois outros sujeitos (número 005 Jill Ratokie e número 006 Amari Garfield). O treinamento intenso matou muitas pessoas, e ainda assim, através disso tudo, Four e Jill se confortam. No outro lado do espectro, no Laboratório de Augusta, o Dr. Murasame descobre seus planos de criar outro novo tipo artificial: Rosamia Badam. Murasame estuda a memória de Rosamia. Parece que o medo de uma colônia cair amplificou o potencial do novo tipo. Para fazer isso, Amari e Jill seriam usadas.