Confessar sua paixão não é tarefa fácil para nenhum adolescente, e não é diferente para Chiyo Sakura, que foi poupada do atraso no primeiro dia de aula na Academia Romana por Umetarou Nozaki. Tocado por sua ação, Sakura começa a desenvolver sentimentos em relação a ele. Em um dia fatídico do segundo ano do ensino médio, Sakura finalmente reúne coragem para confessar. Engolindo seus medos, ela revela a ele em uma sala de aula depois da escola. No entanto, sem o conhecimento dela, Nozaki é na verdade um elogiado artista de mangá shoujo que trabalha sob o pseudônimo de "Sakiko Yumeno". Seu trabalho é aclamado por ser sensível aos sentimentos das meninas, mas o próprio Nozaki não tem experiência com amor ou em um relacionamento. Tudo isso resulta em que ele não entende a confissão de Sakura como nada além de elogios de uma fã e ele simplesmente entrega seu autógrafo. Um mal-entendido leva a outro, e ela de alguma forma acaba trabalhando como assistente de seu mangá. Gekkan Shoujo Nozaki-kun segue Sakura enquanto ela continuamente tenta transmitir seus sentimentos ao esquecido Nozaki enquanto o ajuda com seu mangá, além de conhecer seus assistentes peculiares que por coincidência também frequentam a Academia Romana.
Gekkan Shoujo Nozaki-kun foi publicada em inglês como Monthly Girls Nozaki-kun pela Yen Press desde 17 de novembro de 2015.