No mundo de Daikuuriku, todo mundo nasce mulher e escolhe o sexo que deseja se tornar aos 17 anos. Neste mundo, a teocracia pacífica de Simulacrum é guardada por máquinas voadoras mágicas chamadas "Simoun", que só podem ser pilotadas por jovens. meninas que ainda não escolheram um sexo. O Simoun pode ativar um poder mágico conhecido como "Ri Maajon" que pode destruir um grande número de inimigos ao mesmo tempo. Quando a nação industrializada de Argentum decide que precisa invadir Simulacrum para adquirir o segredo da Simoun, a guerra começa, atraindo a Simoun "Sibyllae" (sacerdotisas que voam a Simoun) para uma batalha desigual. Como a guerra está em fúria, as Sibyllae recebem uma isenção de escolher um sexo permanente enquanto estiverem dispostas a continuar voando. Aaeru, uma jovem Sibylla determinada com um passado misterioso, e Neviril, líder de Chor Tempest, Simulacrums, esquadrão de elite da elite de Simoun , deve liderar suas irmãs sacerdotisas em conflitos tanto dentro de suas fileiras quanto no céu. (Fonte: MU)