A nova vida de Kenshins o leva a Tóquio, onde se junta ao Kamiya Kasshin-ryû dojo para aprender a arte das "espadas que dão vida". O dojo é pacífico, mas nunca é entediante, pois o Kenshin e seu colega aprendiz Yahiko treinam sob os auspícios exigentes de seu instrutor de bom coração, Kamiya Kaoru. Mas tudo isso muda uma tarde quando Tae, do restaurante Akabeko, chega com uma panela de ensopado de carne e um pedido de ajuda. Um dos frequentadores do restaurante perdeu o livro precioso de seu mestre e, se não conseguir recuperá-lo, seja expulso na rua. O simples caso de um livro desaparecido logo se torna um mistério perigoso, pois Kenshin e seus amigos se enredam em segredos profundos e tramas sombrias!