Junpei Iori é o melhor amigo dos Personagens Principais, embora os dois se encontrem em desacordo. Ele interpreta o palhaço da turma para mascarar suas inseguranças. A arma escolhida por Junpeis é a espada de duas mãos que ele empunha como um taco de beisebol. Suas Personas se destacam em ataques físicos e buffs de grupo, e também podem lançar magia de fogo fraco. Junpei se junta ao SEES perto do início do jogo. Ele foi encontrado chorando em uma loja de conveniência durante a Hora das Trevas, e não percebeu que tinha o potencial de chamar uma Persona até Akihiko lhe contar sobre isso. Sua decisão de ingressar no SEES foi rápida, e ele imediatamente se mudou para o dormitório deles, para consternação de Yukari.
Junpei luta porque jogar o herói faz com que se sinta menos um perdedor. ele usa seu lugar no SEES para sustentar sua auto-estima, negligencia o seu