Deep Blue é o líder dos alienígenas e a principal razão pela qual eles retornaram à Terra. Deep Blue dormiu dentro da personalidade de Masaya, deixando Masaya sem lembranças de quem ou o que ele realmente era, apesar de manter o nojo do Deep Blues pela maneira como os humanos estavam tratando o meio ambiente.
Masaya é capaz de conter Deep Blue quando ele tenta novamente matar Ichigo, então ele libera o último mew aqua dentro do Deep Blue, que mata Deep Blue e ele mesmo, mas libera uma força de cura em todo Tóquio que restaura Kish à vida e cura as feridas dos Mew Mews, Ryou, Pie e Tart. Embora Deep Blue seja o principal antagonista da série, ele não aparece até o final do sexto volume do mangá.
Para manter a verdadeira identidade de Deep Blue em segredo no anime, ele é listado nos créditos originais dos dois primeiros episódios como "Mysterious voice" com um ponto de interrogação no lugar do nome de seu ator de voz. Após o segundo episódio, ele é listado pelo nome, mas o ponto de interrogação permanece no lugar do ator de voz até o episódio quarenta e nove, quando sua identidade é revelada. Nesse momento, os créditos são alterados para mostrar que o ator de voz é Megumi Ogata, que também faz a voz de Masaya e o Cavaleiro Az
Ao contrário de Masaya, Deep Blue é de natureza fria e de coração cruel. Quando ele emerge, ele ataca Ichigo, cortando seu braço. Ele também ignora o pedido de Kish para não magoar Ichigo, determinado a matar qualquer um que o desafia. Quando Kish mais tarde desafia Deep Blue a um duelo para proteger Ichigo, Deep Blue o mata sem qualquer hesitação. Matar Kish permite que a personalidade de Masaya reapareça temporariamente.
No anime, no entanto, ele aparece na forma de uma luz azul a quem Kish dá relatórios de progresso. No vigésimo sexto episódio, depois que Kish lhe traz um pouco de mew aqua, Deep Blue é mostrado em uma versão sombreada de sua verdadeira forma até seu completo despertar no episódio quarenta e nove. A morte de Deep Blue também é alterada no anime, com Masaya ainda segurando Deep Blue na baía, mas sendo Mew Ichigo quem usa seu ataque final para matar Deep Blue e libertar Masaya.
Deep Blue adormeceu dentro da personalidade de Masaya, deixando Masaya sem memória de quem ou o que ele realmente era, embora ele mantivesse o desgosto de Deep Blue pela maneira como os humanos estavam tratando o meio ambiente.