Um programa de controle mestre quase orgânico para o navio Mizuhos. Totalmente auto-reparável e sem manutenção. Paira em um innertube e, ocasionalmente, toca um violão em miniatura. Devido a Kei o atacar com medo durante uma tentativa inicial de fuga, quando Mizuho revelou sua verdadeira identidade, a programação de Maries ficou embaralhada, colocando em risco Kei e Mizuho. Comunicando-se parcialmente através de sons indistintos e através de gestos, Marie é essencialmente um link portátil para o sistema operacional dos navios. Mas ele também é capaz de emoção, como testemunha o relacionamento romântico formado entre ele e Miruru e sua tristeza pela separação. Além disso, no OVA, eles estão implícitos a fazer sexo, e os dois se tornam embaraçados quando vêem os outros demonstrando afeto. A implicação fornecida nos extras da série é que Marie e Miruru são apenas extensões dos próprios navios, e assim são os navios.