O Doutor Onishi, geralmente conhecido apenas como o Doutor, é o principal cientista do projeto secreto de pesquisa psíquica que também atua como consultor científico do Coronel. Ele pertencia à segunda geração de cientistas que supervisionava o projeto depois que Akira matou a última. É sua curiosidade e negligência pelo bem-estar de qualquer pessoa que libera e nutre o poder destrutivo da Tetsuos em primeiro lugar.