Akane Shinjou é um fã de Kaiju de "boa fé" e estudante do ensino médio que frequenta na mesma escola que Yuta Hibiki, Rikka Takarada e Shō Utsumi. Ela é a garota mais popular da escola, mas age especialmente amigável com Yuta, falando com ele quando ele está sozinho e compartilhando sua comida com ele. Ela também é uma velha amiga de Rikka, mas hoje em dia eles deixaram de ser próximos como costumavam fazer. No passado, Akane conheceu um alienígena chamado Alexis Kerib que tinha o poder de ajudar Akane a governar o mundo como ela queria. Ela aceitou a oferta, eles se tornaram amigos e Alexis digitalizou-se para que ele pudesse viver dentro do computador de Akane. Então, Akane, sendo a fã de Kaiju que ela é, começou a fazer esculturas de Kaiju, e Alexis, com seu poder "Instance Abreaction" trouxe-as à vida. Com seus Kaijus, Akane começou a moldar o mundo como ela achou adequado. Com um Kaiju, ela poderia matar alguém que ela não gostava, e depois disso, com um tipo especial de Kaiju chamado "Mist Kaiju", as memórias de todos dessa pessoa seriam apagadas ou editadas, para que ninguém perdesse. Por causa de suas ações, a Hiper Agente Gridman veio do Hiper Mundo para acabar com o reinado de Akane e impedir Alexis de usá-la como uma maneira de controlar o mundo ele mesmo.
Durante a série, Akane e Rikka se tornam amigos novamente.
Alexis Kerib viu nela uma chance de ser um deus, então ele usou sua fraqueza emocional como uma maneira de fazê-la concordar em uma "parceria" com ele, na qual ele poderia usar sua Abreação de Instância para fazer Kaijus de Akane ganhar vida e ajudá-la a manter seu mundo como ela quer, matando muitas pessoas no progresso. Depois de descobrir isso, Yuta, Rikka e Utsumi se unem com Gridman e os Alunos do Ensino Médio Neon Genesis para parar Akane e ajudá-la a acordar desse sonho duradouro em que ela está.
Depois de fazer tudo o que pode para tentar parar a Aliança Gridman, e até mesmo se tornar uma Kaiju, Gridman salva Akane da influência de Alexis e restaura o mundo como era originalmente, restaurando a mente quebrada de Akane. No final, Akane diz adeus aos seus amigos e ao mundo que ela criou, deixando todos viverem suas vidas como quiserem, e retorna ao seu mundo real.
Mais tarde na série, é revelado que Akane é na verdade uma deusa que fugiu de seu "mundo real" e construiu o mundo que conhecemos por si mesma. Cada pessoa, cada edifício foi feito pela própria Akane e para ela.