Jiraiya é um dos três ninjas poderosos originários de Konoha (vila escondida nas folhas) e treinado pelo terceiro Hokage, Hiruzen Sarutobi. Seus dois companheiros de equipe eram Tsunade e Orochimaru. Mais tarde, eles ficaram conhecidos como o Lendário Três Ninja, também conhecido como "Sannin". Jiraiya também é um pervertido. Ele adora mulheres bonitas e costuma se distrair com a visão. Ele muitas vezes explica o motivo de estar pesquisando seus textos. Jiraiya é o autor da série Icha Icha que Kakashi gosta de ler. Entre outras características, ele é um domador de sapos, com a capacidade de convocar sapos poderosos à vontade para ajudá-lo na batalha. Ele tem um papel fundamental no ensino e treinamento de Naruto.
Jiraiya também treinou o 4o Hokage, Minato Namikaze. Outro de seus notáveis alunos foi Nagato, que mais tarde se tornaria conhecido como Pain. Quando Jiraiya se infiltra na aldeia de chuva para obter informações relativas a Pain, ele morre em batalha contra todos os seis Pains.