Gozaburo foi o fundador e CEO original da Kaiba Corporation, que na época era um fabricante de armas de sucesso. Ele também era um campeão mundialmente famoso de xadrez, e foi assim que Seto e Mokuba ouviram falar dele no orfanato. Quando Gozaburo o visitou, Seto o desafiou para um jogo de xadrez, dizendo a Gozaburo que, se recusasse, contaria à imprensa que estava com medo de uma criança. Gozaburo, confiante de que não seria espancado por uma criança, concordou em um único jogo, com Seto afirmando que, se ele vencer, Gozaburo concordará em adotá-lo e a seu irmão. No mangá, Seto trapaceou. No anime, Seto passou um tempo estudando as estratégias de Gozaburos e como superá-las, e assim o derrotou. Gozaburo teve que manter o fim da barganha. No entanto, ele era um pai cruel com Seto, forçando-o a gastar todo o seu tempo estudando e renunciando a qualquer alegria ou diversão normalmente associada à infância. Nesse ponto, seu filho biológico Noah também morreu. Com o seu herdeiro da Kaiba Corp, digitalizado, Gozaburo decidiu criar Seto como seu herdeiro, empurrando-o ainda mais. Seu erro fatal foi quando ele deu a Seto 2% das ações da Kaiba Corp como parte de uma missão para ganhar 100 vezes a quantia em um ano - algo que Seto faz com facilidade. Mais tarde, Seto, juntamente com o conselho de administração, também conhecido como The Big Five, compra 49% da empresa. Gozaburo, também com 49%, é deposto por Setos 51%. É relatado que ele se suicidou pulando do último andar do edifício da Kaiba Corporation. (no anime inglês, ele fugiu e desapareceu.)
É revelado que Gozaburo digitalizou sua mente como fez com seus filhos, e se escondeu dentro dos bancos de computadores da Kaiba Corp.